Simone主角苗木诚与一群与他相处二年但是失去记忆的同学进行互相残杀，杀死一人后进行搜查找线索然后投票处死杀人犯。桑田杀死舞园，大和田杀死不二咲，塞蕾丝杀死山田和石丸，大神樱自杀，最后剩下苗木雾切十神叶隐朝日奈腐川六人。
黑幕实为黑白熊的操纵者——江之岛盾子的姐姐战刃骸，其装作江之岛与苗木诚一行人度过两年时光，江之岛的目的是使他人绝望【很复杂就先不解释了】，并把一行人的互相残杀全世界直播。
希望之峰学院则是培养人才的地方，寻找能力超出他们这个年龄所应得的高中生加以培养，是希望的象征。
世界观：
本作在背景设定方面，游戏中当玩家们找出犯人的时候，犯人将会因此而被处置杀害。不过如果玩家们不能找出真正的犯人，导致在“学级裁判”里中了真正犯人的诡计陷阱，而将其他无罪的人误判为犯人。
此时真正的犯人将可以因此而获得免罪毕业，而其他的学生则都会被一律以误判罪名全员处死，因此玩家在决定犯人身份的时候，务必特别小心才行。
玩家在游戏中将化身为由日本人气声优配音员绪方惠美负责声音演出的主角───苗木诚。
当主角与包含自己在内，有着各式各样不同风格与擅长领域的15名超高校级学生一起参加入学典礼的时候，却看到一个自称是学园长的活动布偶熊表示：“一旦进来，就必须要一辈子都待在这里才行。如果想要毕业离开的话，只要互相残杀就好了！”
就这样，因为这个不合理的理由，这群被关在这个绝望学园的高材生们，陷入除了杀人之外就是被杀的阴谋当中，加上破坏学生之间信赖关系的卑劣“学级裁判”制度，更让整个真相陷入扑朔迷离当中
