Simone蒋介石去世后，废除“总裁”制，党的首脑改称中央委员会主席，由蒋经国连任至1988年1月13日去世。
1949年，中华民国政府在国共战争中节节败退，而中国共产党则于10月1日在北京（昔称北平）成立中华人民共和国。中华民国政府从南京陆续迁至广州、重庆、四川成都及西康西昌，最后于12月9日迁至台湾台北；12月11日，中国国民党中央党部随政府由成都迁毕册袭至台北。
蒋介石去世后，废除“总裁”制，党的首脑改称中央委员会主席，由蒋经国连任至1988年1月13日去世。其后则由李登辉继任至2000年3月。期间地位为台湾地区执政党。其后台湾地区领导人由台湾民主进步党人士陈水扁继任姿李，在此期间中国国民党成手兄为台湾地区最大在野党，直到2008年中国国民党人士马英九竞选成功，中国国民党才再度成为台湾地区执政党。
