Simone
二者的区别就是：后者包括前者，也就是政府系统是被包含在党政机关内的，换句话说就是政府系统是党政机关的一部分。
政府机关：在广义上指中央和地方的全部立法、行政、司法和官僚机关。狭义的政府机构仅指中央和地方的行政机关、官僚机关，即依照国家法律设立并享有行政权力、担负行政管理职能的那部分国家机构，在我国，亦称为“国家行政机关”。包括：国家各部委及其省市县等各级行政机关。是由各级人民大会选举产生的。
党政机关：党政机关，广义上包括党的机关、人大机关、行政机关、政协机关、审判机关、检察机关。也包括各级党政机关派出机构、直属事业单位及工会、共青团、妇联等人民团体。党的机关从严格意义上来讲应该是一种社会组织，是受党的领导，无法律授予的公权利。党政机关是国家非常特殊也至关重要的群体组织。
政府是党领导的，党和政府有不同系统的。党委系统比如省委、市委、县委、各级组织部、宣传部等，政府系统如中央人民政府、省人民政府、市人民政府、县人民政府、乡人民政府等。
党政机关是党委机关和政府机关的合称。政府系统指从属于政府领导的整个系统
