1949年9月,国立中正大学(1940~1949)更名为国立南昌大学(1949~1950),设政治学院、文学艺术学院、理学院、工学院、农学院,16个系。1949年更名后,学校仍为国立综合性大学,直属中南局领导。
1950年10月去“国立”二字,直称“南昌大学”(1950~1953)。
1952年,以南昌大学农学院为基础,单独组建了江西农学院(现江西农手伍咐业大学),继承了国立中正大学的农学院并延续至今,为原国立中正大学的分支;1953年在全国高校院系调整中,南昌大学部分学科、专业调整至中南区的武汉大学、中毕纯山大学、华中工学院等14所高校,与此同时,保留了中文、历史、生物、数学、物理、化学和艺术7科的部分专业及老师,学校改为江西师范学院(现江西师范大学),江西师范学院继承了南昌大学全部校舍场地,大部分图书资料,一部分仪器设备。南昌大学给江西师院留下了三分之一的教师,大部分职员和全部工人。江西师院不是以师范部为基础或主体建立的,因为师范部本身没有校舍场地,没有图书资料,没有仪器设备,甚至没有形成自己的教师队伍。根据南昌大学的1952年12月教职员录,师范部9个科除艺术科独立设置外,8个科(含中语、史地、教育、数学、物理、化学、生物、体育)的科主任都是文法学院、理学院和体育专修科各有关系科的系科主任兼的;也就是说,它们是挂靠在有关系科的。南昌大学留给江西师院教师75人,79%是文法学院和理学院教师,师范部教师只16人,其中艺术科教师就有6人,占38%。南昌大学给江西师院留下了理学院院长郭庆棻 、副教务长谷霁光、副总务长熊化奇、数学系主任彭先荫、文史系代主任欧阳琛、艺术科主任刘天浪、还有校务委员吴士栋,而师范部主任任言没有留下,调到华南师范学院。由此可以认为,江西师院是南昌大学的直接继承者,南昌大学为江西师院的发展奠定了坚实的基础。为什么说坚实的基础?我们不说校舍、图书、仪器,仅就教师队伍来说,南昌大学留下教授12人,副教授16人,共占教师总数的37.3%,远远高于当时全国高校教授、副教授占教师总数平均23.1%的比例),性质由综合性大学改变为培养中等学校师资的高等师橘卜范院校。1962年,江西师范学院生物系又被调至江西大学(今新南昌大学)。